芝加哥深盘披萨采用反向分层系统。它将酱料铺在奶酪上方。这能防止奶酪在长时间高温烘烤中烧焦。 传统披萨将奶酪铺在最上面。芝加哥深盘披萨则改变了这种做法。它将酱料作为保护盖。这种披萨的饼底厚约5厘米。它需要在烤箱中烘烤30到45分钟。